Bacteriologia:

• Epidemiologia e Caracterização Molecular de Mycobacterium  spp.  Prof. Dra. Cristina Viana Niero.
• Estudamos aspectos epidemiológicos e os mecanismos e determinantes genéticos de patogenicidade envolvidos no estabelecimento de doenças por Escherichia coli e E. albertii. Caracterizar novas adesinas para colonização intestinal e compreender os mecanismos de invasão e de indução de produção de muco. Prof. Dra. Tânia A. Tardelli Gomes do Amaral.

Imunologia:

• O papel das células iNKT em contextos inflamatórios e o uso de seus agonistas como imunoterapia. Prof. Dr. Alexandre C. Keller.
• Neuroimunologia; Neuroimunomodulação; Interações Neuro-Imunes. Prof Dr. Alexandre S. Basso.
• Aspectos moleculares da diferenciação e transformação celular de linfócitos B-1. Prof. Dra. Ana Flavia Popi.
• Desenvolvimento e avaliação de novos candidatos vacinais contra o HIV, Zika, Chikungunya e SARS-CoV-2; Estudo do efeito da privação de sono na imunidade. Prof. Dra. Daniela Santoro Rosa.
• Desenvolvimento de alternativas terapêuticas antitumorais em modelos experimentais e avaliação da resposta imune de indívíduos idosos após intervenções que visam aumentar a qualidade de vida dos mesmos. Prof. Dra. Elaine Guadelupe Rodrigues.
• Mecanismos imunológicos gerados por diferentes protocolos imunização utilizando genes de Trypanosoma cruzi e estudo da expressão de integrinas e receptores de quimiocinas em células do sistema imune após imunização genética. Prof. Dr. José Ronnie C. Vasconcelos.
• Transformação maligna de melanócitos e progressão do melanoma: papel do estresse celular e de mecanismos epigenéticos. Prof. Dra. Miriam Galvonas Jasiulionis.
• Investigação do papel de macrófagos pleurais durante infecções pulmonares. Prof. Dra. Fernanda Vargas e Silva Castanheira.

Micologia:

• Epidemiologia molecular de fungos de importância médica, diagnóstico das infecções fúngicas, taxonomia e sistemática de fungos. Prof. Dr. Anderson Messias Rodrigues
• Mecanismos celulares envolvidos durante a interação entre fungos patogênicos e células epiteliais. Prof. Dra. Erika Suzuki de Toledo.
• Identificação e caracterização de componentes biologicamente ativos de frações extracelulares e de superfície celular de Paracoccidioides brasiliensis e outros fungos patogênicos. Prof. Dra. Rosana Puccia.
• Resposta ao estresse oxidativo e nitrosativo de fungos patogênicos e identificação de fatores de virulência. Prof. Dr. Wagner Luiz Batista.

Parasitologia:

• Vesículas extracelulares de patógenos e sua relevância em doenças infecciosas. Prof. Dra. Ana Claudia Torrecilhas
• Biologia Molecular de Trypanosoma cruzi: Sintenia e aneuploidia, evolução cromossômica em tripanossomas de morcegos, análise genômica comparativa entre Trypanosoma cruzi, Trypanosoma rangeli e Trypanosoma conorhini e origem e evolução das famílias multigênicas SAP (Serine-, Alanine- and Proline- rich proteins) e RHS (Retrotransposon Hot Spot proteins) de Trypanosoma cruzi. Prof. Dr. José Franco da Silveira Filho.
• Estudo das vias de sinalização e seu papel na regulação da expressão gênica em Schistosoma mansoni. Prof. Dra. Kátia Cristina Pereira Oliveira Santos.
• A origem evolutiva e da diversidade de genótipos do Trypanosoma cruzi utilizando probabilidades condicionais (Bayesianas) em filogenias e redes evolutivas. Prof. Dr. Marcelo Ribeiro da Silva Briones.
• Mecanismos envolvidos na adaptação dos Tripanossomatídeos aos diferentes ambientes encontrados durante a transição do hospedeiro invertebrado para seu hospedeiro vertebrado, com ênfase no papel da acetilação proteica como reguladora primária de diversos processos celulares. Prof. Dr. Nilmar Silvio Moretti.
• Desenvolvimento de parasitas transgênicos utilizando a técnica de CRISPR/Cas9; Avaliação do efeito de drogas antimaláricas;  Caracterização de sequências reguladoras de transcrição e uso da tecnologia de “Single Cell RNAseq” para identificação e caracterização de formas sexuadas (gametócitos). Prof. Dr. Roberto Rudge de Moraes Barros.
• Mecanismos de resposta, escape e sobrevivência de parasitas protozoários nos seus hospedeiros, com ênfase em Trypanosoma cruzi. Prof. Dr. Sérgio Schenkman.
• Cromatina de tripanossomas e células de mamíferos: análise proteômica e funcional. Prof. Dra. Julia Pinheiro Chagas da Cunha.
• Estudo das alterações imunopatológicas induzidas durante coinfecções heterólogas (alphavirus e protozoários) em modelo murino. Prof. Dra. Carla Claser.

Virologia:

•  Epidemiologia molecular dos Arbovírus emergentes, estudos aplicados à relação vírus-hospedeiro e mecanismos de replicação viral em diferentes linhagens celulares. Profa. Dra.  Carla Torres Braconi dos Santos.
• Estudo dos mecanismos de patogênese de vírus emergentes e reemergentes. Prof. Dra. Juliana Terzi Maricato.
• Diversificação viral nas epidemias, em cultivo celular, e através de modelos computacionais com ênfase no HIV-1. Prof. Dr. Luiz Mário Ramos Janini.