Dra. Julia Pinheiro Chagas da Cunha

Título: Professora Doutora
Laboratório: Laboratório Especial de Ciclo Celular, Instituto Butantan
Telefone: 55 11 2627-9731
E-mail: Este endereço de email está sendo protegido de spambots. Você precisa do JavaScript ativado para vê-lo.
Lattes: http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=P325297

Linha de Pesquisa

Epidemiologia molecular, diversidade genética, evolução, vias de sinalização e regulação de expressão gênica em parasitas. Alterações nucleares em células eucarióticas. Indo a fundo na regulação da cromatina de Trypanosoma cruzi: identificação de novas moléculas e questionando seu possível impacto no controle da transcrição.

Resumo

O núcleo, em especial a cromatina, desempenha funções envolvidas com a regulação e gerenciamento de ações no genoma que culminam com o controle da expressão gênica, do ciclo e do fenótipo celular. Modificações pós traducionais (MPTs) em histonas estão associadas a importantes processos regulatórios em uma célula. Nosso projeto visa estudar as alterações nucleares e na cromatina ao longo do ciclo celular e senescência de parasitNosso grupo identificou diversas proteínas associadas à cromatina, assim como mais de 40 Modificações Pós-Traducionais (MPTs) em histonas, com expressão diferencial entre formas replicativas e não replicativas de Trypanosoma cruzi. Observamos mudanças dramáticas nas regiões clássicas de eu e heterocromatina durante a diferenciação de epimastigotas para metacíclicos. Embora a regulação da transcrição esteja tradicionalmente ligada a essas regiões, em tripanossomas, os mecanismos pós-transcricionais são predominantes devido à ausência de regiões promotoras clássicas de RNA Pol II e à transcrição predominantemente policistrônica. Nosso objetivo é compreender essa aparente contradição, investigando o papel da regulação da cromatina no controle da transcrição. Utilizando técnicas avançadas como GRO-seq, CLASP ou enCHIP e inserção de genes repórter locus-específicos com CRISPR/Cas9, planejamos avaliar a taxa de transcrição global, o efeito da localização genômica na expressão gênica e o conteúdo da cromatina em locais específicos. Esperamos que essa abordagem em Trypanosoma cruzi, um organismo com peculiaridades genômicas, seja fundamental para entender a regulação da cromatina e possa revelar novos mecanismos importantes.

Estratégias

• Análise proteômica quantitativa
• Modulação da expressão gênica por interferência de RNA
• Biologia computacional para a integração e interpretação dos resultados.

Principais publicações

1. Florentino, P. T. V., Vitorino, F. N. L., Mendes, D., da Cunha, J. P. C., & Menck, C. F. M. (2023). Trypanosoma cruzi infection changes the chromatin proteome profile of infected human cells. Journal of proteomics, 272, 104773. https://doi.org/10.1016/j.jprot.2022.104773
2. de Luna Vitorino, F. N., Levy, M. J., Mansano Wailemann, R. A., Lopes, M., Silva, M. L., Sardiu, M. E., Garcia, B. A., Machado Motta, M. C., Oliveira, C. C., Armelin, H. A., Florens, L. A., Washburn, M. P., & Pinheiro Chagas da Cunha, J. (2023). The antiproliferative effect of FGF2 in K-Ras-driven tumor cells involves modulation of rRNA and the nucleolus. Journal of cell science, 136(22), jcs260989. https://doi.org/10.1242/jcs.260989
3. Fragoso, M. S. I., de Siqueira, C. M., Vitorino, F. N. L., Vieira, A. Z., Martins-Duarte, É. S., Faoro, H., da Cunha, J. P. C., Ávila, A. R., & Nardelli, S. C. (2023). TgKDAC4: A Unique Deacetylase of Toxoplasma's Apicoplast. Microorganisms, 11(6), 1558. https://doi.org/10.3390/microorganisms11061558
4. Menezes, A. P., Murillo, A. M., de Castro, C. G., Bellini, N. K., Tosi, L. R. O., Thiemann, O. H., Elias, M. C., Silber, A. M., & da Cunha, J. P. C. (2023). Navigating the boundaries between metabolism and epigenetics in trypanosomes. Trends in parasitology, 39(8), 682–695. https://doi.org/10.1016/j.pt.2023.05.010
5. Chromatin Proteomics Reveals Variable Histone Modifications during the Life Cycle of Trypanosoma cruzi. de Jesus TC et al. J Proteome Res. 2016 Jun 3;15(6):2039-51.
6. Quantitative Proteomic Analysis of Replicative and Nonreplicative Forms Reveals Important Insights into Chromatin Biology of Trypanosoma cruzi. Leandro de Jesus et al. Mol Cell Proteomics. 2017 Jan;16(1):23-38.
7. Distinct acetylation of Trypanosoma cruzi histone H4 during cell cycle, parasite differentiation, and after DNA damage. NARDELLI, S. C et al. Chromosoma. 2009
8. Bioinformatics construction of the human cell surfaceome. da Cunha, J. P. C. et al. PNAS. 2009
9. Post-translational modifications of Trypanosoma cruzi histone H4. da CUNHA, J. P. et al. Molecular and Biochemical Parasitology (Print). 2006
10. Trypanosoma cruzi histone H1 is phosphorylated in a typical cyclin dependent kinase site accordingly to the cell cycle. da CUNHA, J. P. et al. Molecular and Biochemical Parasitology (Print). 2005.

Créditos: Ilana Tschiptschin